Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tcirg1Q9JHF5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms