Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PalldQ9ET54 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms