Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn4aQ9ER60 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scn4aQ9ER60 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms