Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Barx1Q9ER42 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Barx1Q9ER42 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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