Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca3a2Q9EQR4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca3a2Q9EQR4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a2Q9EQR4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a2Q9EQR4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a2Q9EQR4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a2Q9EQR4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a2Q9EQR4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a2Q9EQR4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a2Q9EQR4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a2Q9EQR4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a2Q9EQR4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a2Q9EQR4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms