Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf1Q9EPU4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpsf1Q9EPU4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms