Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubiad1Q9DC60 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubiad1Q9DC60 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubiad1Q9DC60 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubiad1Q9DC60 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms