Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syde1Q9DBZ9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms