Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg8Q9DBM0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms