Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tmem239Q9DA47 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tmem239Q9DA47 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tmem239Q9DA47 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem239Q9DA47 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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