Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms