Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg7Q9D906 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms