Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms