Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn22Q9D7U6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms