Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tube1Q9D6T1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms