Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab11fip1Q9D620 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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