Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam90a1bQ9D4F3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam90a1bQ9D4F3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms