Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms