Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms