Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bcas2Q9D287 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms