Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms