Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan11Q9D1D1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms