Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Zbed3Q9D0L1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Zbed3Q9D0L1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Zbed3Q9D0L1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Zbed3Q9D0L1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Zbed3Q9D0L1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Zbed3Q9D0L1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Zbed3Q9D0L1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Zbed3Q9D0L1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms