Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms