Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ube2fQ9CY34 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2fQ9CY34 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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