Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl11Q9CXW4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms