Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CXL3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CXL3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CXL3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CXL3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CXL3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CXL3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CXL3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CXL3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms