Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf1Q9CWX2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms