Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxxc1Q9CWW7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms