Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl3Q9CUS9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms