Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms