Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snw1Q9CSN1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms