Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf138Q9CQE0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf138Q9CQE0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms