Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp2Q9CQ73 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms