Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn6Q99PL6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn6Q99PL6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms