Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930550L24RikQ99PA7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930550L24RikQ99PA7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms