Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf17Q99MV7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms