Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm2d1Q99MB3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms