Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms