Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf19Q99KP6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms