Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ciao1Q99KN2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ciao1Q99KN2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms