Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms