Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep3Q99KK1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Reep3Q99KK1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms