Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Emc3Q99KI3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Emc3Q99KI3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms