Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddb2Q99J79 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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