Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms