Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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