Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim59Q922Y2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms