Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf3Q922U1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf3Q922U1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms