Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Afg3l1Q920A7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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